Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms