Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN3Q9UKA8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN3Q9UKA8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms