Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SALL4Q9UJQ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms