Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms