Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUF60Q9UHX1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms