Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX20Q9UHI6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms