Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC3Q9UHC3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms