Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SWAP70Q9UH65 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWAP70Q9UH65 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms