Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3BQ9UH17 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms