Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R1BQ9UD71 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms