Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPS7AQ9UBW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms