Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms