Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLKQ9UBT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms