Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG4Q9UBN1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms