Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms