Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN10Q9UBB4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN10Q9UBB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms