Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH10Q9P2E7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms