Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP5Q9NZZ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms