Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH8Q9NYR8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms