Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC3Q9NYG2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms