Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms