Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF2Q9NX18 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF2Q9NX18 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms