Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf42Q9NWW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf42Q9NWW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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