Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms