Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTLC3Q9NUV7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC3Q9NUV7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms