Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMC4Q9NTJ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC4Q9NTJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms