Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TREX1Q9NSU2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX1Q9NSU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms