Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms