Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA4L2Q9NRX3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFA4L2Q9NRX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms