Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PXMP2Q9NR77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PXMP2Q9NR77 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PXMP2Q9NR77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms