Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms