Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ASCL3Q9NQ33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms