Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms