Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FZD3Q9NPG1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms