Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMG20AQ9NP66 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMG20AQ9NP66 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms