Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARFGAP3Q9NP61 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP3Q9NP61 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms