Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFT1Q9NNX1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms