Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F12Q9HCS2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms