Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC4Q9HBW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4Q9HBW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms