Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LY9Q9HBG7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LY9Q9HBG7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LY9Q9HBG7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms