Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMURF2Q9HAU4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms