Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD3Q9H7B4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD3Q9H7B4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms