Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D4AQ9H788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SH2D4AQ9H788 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4AQ9H788 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms