Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDT1Q9H211 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDT1Q9H211 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms