Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK2Q9H0K1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK2Q9H0K1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms