Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms