Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LNPKQ9C0E8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms