Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC2Q9C0B9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC2Q9C0B9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms