Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM4Q9C037 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM4Q9C037 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms