Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM9Q9C026 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM9Q9C026 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM9Q9C026 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms